受美中贸易摩擦和新型冠状病毒疫情对全球贸易的影响，巴拿马运河在2020财年间运输量为4.751亿巴拿马运河吨（PC/UMS），比预期下降4%，但仍创下了新纪录。
巴拿马运河管理局（ACP）近日披露了2020财年吞吐量数据。2020财年，共有13369艘船通过巴拿马运河，比最初预期下降2%，货物总量较上一财年（4.69亿吨）高出约1％，达到了4.751亿吨，虽然巴拿马运河2020财年的货运量打破了此前的最高纪录，却仍较预期低4%。
船舶过境的减少反映出2020年由于疫情原因导致全球贸易量预计减少5%，其中巴拿马运河主要客户美国的贸易量预计会下降8%。
巴拿马运河管理局称，在2019年10月1日至2020年9月30日的财年期间，巴拿马运河经历了截然不同的两种情况，上半年表现超出预期，随后又经历了扰乱全球经济和生活的疫情。
在今年5月和7月间，疫情对巴拿马运河的影响达到顶峰，随着客船、汽车运输船和LNG船减少，过境船舶下降了20%。之后，过境船舶数量和货物运输量在8月至9月陆续恢复正常。
集装箱船仍是巴拿马运河吞吐量的主要组成部分，2020财年吞吐量为1.663亿巴拿马运河吨，占总吞吐量的35%。
其次是散货船，总计8090万巴拿马运河吨，油船/化学品船为6920万巴拿马运河吨，LNG船4640万巴拿马运河吨，LPG船4460万巴拿马运河吨。
巴拿马运河管理局认为，巴拿马运河在2020财年的表现“反映了全球经济趋势”。根据国际货币基金组织（IMF）的估计，由于新冠病毒的大流行，全球生产总值将于今年萎缩5%至6%。
据介绍，巴拿马运河长约80公里，世界贸易中的3.5％需要从这里经过，其三大用户是美国、中国和日本，最主要的航运服务路线为亚洲至北美东海岸。
巴拿马运河管理局负责人Ricaurte Vásquez Morales表示，运河的首要任务是确保团队将近一万名员工的福祉，并重申其承诺，适应疫情带来的变化，保证“供应链不中断”，确保海运持续运作。
巴拿马运河管理局已决定将其临时救济措施，延长至今年12月31日，为该行业复苏提供进一步支持，这些措施包括暂停支付过境保留费的预付款，及对航道预约系统的其他变动。
