中方与土库曼斯坦在制度和政策上都存在不可忽视的问题。中方对出口产品的控制力度不够严格。目前在土库曼斯坦大部分老百姓不愿意使用中国制造的产品。原因是在于中国制造的产品质量的确是参差不齐，而且生意人更注重利润，对于商人来说成本越低其利润越高。而中国的市场正好是这种低成本产品的发源地。这种现象毁坏了“中国制造”的名誉。为了多赚钱，追求更大的利润，土库曼的商人进口价格低质量也相当低的产品，再以高价销售，老百姓经过一段时间发现这种中国制造的产品并非价廉物美，从而对中国的产品失去了信心。这是中土贸易初期存在的严重问题，而且该问题所带来的负面影响至今没有消除。土库曼没有完善进口政策。中土贸易虽然不断发展，贸易额逐年递增，但是土方尚未有一个完善的进口政策，由此导致在大批量进口商品时，相关手续相当复杂，所需文件繁多，进口的货物必须通过证券交易所那导线管机构的许可证。
外贸企业办理大部分手续需要很长时间。诸如此类的问题导致了在港口或者边境压货的现象。因为没有上述文件进口的货物不许入境。而且导致了一些没有道德的竞争，很多商户为打压竞争对手，通过不正当的渠道将对方的货物被在港口或者边境，而在自己的同类产品销售完了才释放其他商户的货物。不正规的通关手段也跟上述的问题密切相关；就是因为手续非常复杂而且需要花很长的时间好多商人选择灰色清关。这种清关方式是不正规的，虽然政府默认的但是法律不认可的。
土库曼斯坦的贸易伙伴仍相对集中在东欧和欧洲，特别有限的几个国家，如俄罗斯，乌克兰和土耳其，与这三国的贸易额占到总额的一半多。这种贸易格局不具备足够的抗风险能力，一个明显的例子就是近来由于这几个主要贸易伙伴经济不景气纷纷采取保守的贸易政策，使得土库曼斯坦的对外贸易额受到了较大的影响。简单的例子是乌克兰与俄罗斯之间的政治问题。乌克兰与俄罗斯因为债务问题一直纠缠不清，两国在这个问题上花了几个月的时问才达成协议。这几个月两国的争端对于土库曼斯坦的对外贸易造成了损失，解其原因是因为乌克兰用的是土库曼斯坦的天然气，俄罗斯赚的是差价而己，实际资源是来自于土库曼斯坦。
中国轻工业的主要贸易优势是在于它的价格，其实质是以廉价取胜。这导致了土库曼斯坦的本国企业丧失了市场竞争力。比如土库曼斯坦生产的地毯；土库曼生产的地毯为手工制品，市场上的价格很高，2x2规格的地毯售价在5000到6000元。中国生产的同类地毯的市场价才4000元，而且质量并不次于土库曼的手工地毯。为了避免这种现象出现，为了保护传统的产业土库曼政府对进口某些产品采取了禁止性措施。这些措施在某种程度上妨碍了中途贸易的多样性发展。
中土贸易没有直接的海路运输，货船先到伊朗，然后装卡车再到达土库曼斯坦。整个运输过程耗时一个半到两个月。这种复杂的运输方式导致了货物成本的增加，给进口商带来了诸多不便。铁路运输是通过新疆阿拉山口，据统计，通过该渠道进口的货物极少，因为该运输线路很不安全；它通过新疆过境哈萨克斯坦，然后在到达土库曼。
现在国际石油价格暴跌，土库曼斯坦货币疯狂贬值，外贸企业要靠牺牲利润来开拓土库曼斯坦的市场，这本身就有挑战性。
