自2023年10月1日起，由日本税务局发布的消费税（JCT）合规发票留存制度开始正式生效。日本方面是建议卖家在今年3月31日前提交JCT注册申请，现在陆陆续续也有卖家的JCT税号已经下来了，那么卖家在拥有合规JCT税号后该如何进行税务申报呢？
日本消费税的征税期原则上是一年申报一次，截止申报纳税日期为纳税期截止之日起两个月内。次年开始根据上一个纳税期的销售税额，实行中期申报及纳税制度。如果卖家是免税事业者，基准期的销售额是含税销售额。如果是课税事业者，则基准期销售额是不含税销售额。
并且日本JCT的纳税期会参考海外企业的会计年度做适当的改变。
对于中国大陆公司，一般企业会计的年度是1月1日到12月31日；
对于中国香港公司，有的企业会计年度是7月1日到6月30日，4月1日到3月31日。
·申报方式
在日本，消费税有简易申报和标准申报这两种方法。
符合以下条件的，可以委托税务代理申请简易申报
1.新注册的用户
2.第一个纳税年度应税销售额在5000千万日元以下，第二个纳税年度应税销售额在5500万日元以下，第三个纳税年度在6000万日元以下的企业......以此类推。
简易申报应交税金计算方法：实际应交税金=应税销售额*10% -应交税金*抵扣系数（零售业为80%）
即实际应交的税金只有应交税金的20%，也就是实际应交税金是应税销售额的2%。
▲例如你的企业今年净销售额为1000万日元，消费税为100万日元，且企业全部销售都是零售，经过采购系数80%抵免，需要支付的税金为20万日元，也就是净销售额的2%。
▲如果你家的企业不仅一个经营品类，则需按照采购系数法，对每一类的经营品类进行分类核算，还是运用上面的例子，企业年销售额1000万日元，其中800万日元销售来源于零售（采购系数80%），200万日元来源于批发（采购系数90%），那么按照采购系数抵免法，税金计算如下：
在默认情况下，日本税务局给卖家选择的都是标准申报
标准申报税金应交税金计算方法：实际应交税金=应税销售额*10%-进口/当地采购消费税-亚马逊费用消费税（广告消费税发票除外）
▲例如1000万销售的企业，税金为100万日元，假设企业有效的进项单据有限，进项税加总后抵扣税金金额为50万日元，那么企业按照标准凭票抵扣方式申报的税金是50万，按照简易申报的税金是20万。
关于历史税金是否会被追缴解答
目前日本海关是按照逆算法征收关税和消费税的，如果卖家在法规生效之前，都有在正常缴纳进口消费税，那日本政府是没有理由来追缴卖家的历史税金的，若卖家使用的是包税清关或者固税逆算，并不是海外企业公司抬头，委托ACP合规逆算清关，以长远来看是会有一定的查税补税的风险的。
不过一般日本的税务稽查只调查3年（根据卖家公司的申报情况而定），所以只要连续申报3年以上，可以降低被查税的风险。如果卖家本身是以免税事业者身份注册JCT，建议卖家在进行税务申报时不要去申请退税。历史的税务都没有申报缴纳去申请退税的话，一般会引发查税。
其次日本的JCT和欧洲VAT是不同的，卖家有免消费税的1000W阈值，并不是从开始销售就要求缴税。其次日本税务局会根据基准期来判断卖家企业是否有纳税义务。截至目前为止，已经下号的卖家也没有收到要求补税的通知。
以目前日本国税厅的人力及方向情况来看，日本税务机构暂时不会进行主动查税。如果您的历史销售已经超过了JCT申报阈值，并且不想进行补缴，若税局进行查税，亚马逊可能会需要配合税局要求，提供您的过往销售数据。税局根据店铺历史销售情况可能要求补税和产生罚金。同时，税局也可能会要求亚马逊暂停您的销售权限，直至您的历史税务问题解决。
日本税务局方面是要求符合法规要求的卖家在今年3月31日前提交JCT注册申请的，小编也建议符合注册销售阈值的卖家尽快提交注册JCT税号并且上传到亚马逊平台以获得平台针对拥有JCT税号卖家的流量扶持。
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